傳統建設組織模式下，監理企業多承擔以工程監理、項目管理為主的施工實施階段的管理工作，缺乏財務、經濟、社會、管理等方面的業務，導致前期決策、項目總控、工程設計以及運營維護領域能力不足。開展全過程工程咨詢試點工作以來，相關監理企業開展了全過程工程咨詢服務的技術研發和工程實踐，針對服務模式、管理體系、發展路徑等方面形成了一定的成果。但監理企業的傳統服務模式、業務流程及服務能力還沒有適應新業態的開展，全過程工程咨詢項目實踐在曲折中前進，各業務環節融合度不足，服務模式以簡單的業務疊加為主，難以整合集成組織、資源、技術和管理資源，限制了工程咨詢服務的效果、效益和價值發揮，讓業主對選擇全過程工程咨詢存在風險顧慮。全過程工程咨詢服務是政府引導、市場需求主導而推進的，監理企業應重點根據企業發展戰略加強能力建設，延伸全過程咨詢產業價值鏈，向高附加值的領域有序拓展，培育綜合性全過程工程咨詢服務能力，適應市場多樣化咨詢服務需求。
（1）組織架構。目前多數咨詢企業是根據前期咨詢、招標代理、造價咨詢、工程監理、項目管理等業務板塊進行組織結構劃分形成專業化部門，企業開展一個全過程工程咨詢項目需由不同專業部門合作完成，組織架構如圖1（a）所示；各專業部門抽調資源組成全過程咨詢團隊，分別負責某一個或幾個階段的咨詢服務工作，這僅是將原有階段化、專業化的咨詢服務的簡單疊加，人員仍屬于各專業部門管理，業務開展過程中部門之間很難避免資源整合不力、協調溝通不暢等問題，不能實現系統協同高效管理。為了建立更加有效暢通的協作機制，企業可成立專門的全過程工程咨詢業務部門，組織架構如圖1（b）所示；從企業層面牽引全過程工程咨詢業務，統籌管理各專業部門的人力資源配置、績效分配和成果考核等，根據業務需求調配合適資源為全過程咨詢項目提供咨詢服務工作，強調專業化的資源配置和業務銜接，提高咨詢效率和效益。
（2）業務流程。全過程工程咨詢是全生命周期、多專業、系統性的有機集成，需要對各傳統咨詢業務流程再造與優化，實現有機融合。將全過程工程咨詢服務從前期策劃、工程設計、工程建設、運營維護至服務結束，進一步細化分解與企業專業化發展相適應的業務階段，如圖2所示。針對各階段每項工作業務建立一套標準化的業務流程和工作程序，形成菜單式咨詢服務體系和標準化的工作流程，對外滿足委托方的多樣性和項目獨特性的需求，對內為業務部門開展咨詢服務提供體系化、標準化的指導。承接全過程工程咨詢業務后，全過程工程咨詢業務部門開展業主需求調研，評估項目情況，統籌各專業部門組建項目機構，明確權責分配機制，重點是設計項目組織架構、項目經理、專業負責人及其他崗位配置，并指導完成咨詢規劃的編制；然后由專業部門和項目團隊實施全過程工程咨詢，負責項目總體策劃、設計管理、招標采購、項目管理、造價咨詢和竣工交付、運營維護等工作，項目完成后由全過程咨詢業務部進行服務評價，并對各專業部門進行最終績效考評。
全過程工程咨詢的集成化管理是對項目前期決策、工程建設和運營維護各階段的管理組織、過程、信息等方面進行有機融合和集成優化，通過總體策劃、合同管理、風險管理、人力資源管理等手段實現項目投資、質量、進度、安全等目標集成，強調縱橫向系統化管理，提高項目的整體效益。根據價值鏈理論將建設工程項目全過程咨詢服務劃分為價值規劃、價值形成、價值實現三個階段，其中，項目前期、總體策劃和設計優化屬于價值規劃，也是最能體現咨詢價值和優化成本的階段；價值形成是工程建設階段，是基于項目功能的價值提升和價值實現，價值實現還包括對項目的運營維護，實現項目功能優化和使用增值。
項目價值提升在于基于目標和信息的早期價值管理，全過程工程咨詢項目應建立價值評價模型，以項目全生命周期為主線，以全過程工程咨詢服務內容為要素，建立全過程工程咨詢的業務流和信息流價值鏈接，項目實施過程收集項目中的組織、資源、信息、目標等要素信息，對全過程工程咨詢業務進行價值識別、分析，評價各業務環節的價值鏈關系，建立基于價值鏈的全過程集成化咨詢服務模式，從全生命周期、全方位、全要素的角度進行各價值鏈環節的優化，提高增值業務，降低非增值業務，實現工程項目的目標控制和增值。
建立數字化管理平臺是實現全過程工程咨詢管理協同、業務融合和集成化管理的重要手段。通過以數字化大平臺和BIM技術、大數據、互聯網等技術為支撐，從管理職能（決策、組織、協調）、業務階段（決策、設計、施工、運維）和業務要素（總體策劃、前期咨詢、設計管理、項目管理、組織協調）角度構建全過程咨詢數字化協同管理平臺，平臺架構如圖3所示。
全過程工程咨詢數字化管理系統由前期決策系統、工程設計系統、工程建設系統和運營維護等業務系統組成，并與企業人力、運營和業財系統對接，分別建立各子系統業務模塊的數字化工作流程。
（1）前期決策階段主要以業務流程標準化為主，將不同項目類型的項目建議書、可行性研究報告等文本報告轉變為數據化規則，規范技術文件內容和內部審批流程；
（2）工程設計階段通過數字化管理平臺實現招標采購、設計管理的信息共享和多角色協作；
（3）在工程建設階段，參建各方基于數字化平臺和基于物聯網的實時數據采集開展質量、安全、投資、進度、合同、風險管理、溝通協調及知識管理、數字化交付等工作；
（4）運營階段將數字化交付的模型和核心信息納入運營管理系統，服務于運維管理。
（5）此外,以全過程數字化管理形成企業知識管理的積累、更新、迭代，形成基于數據的決策支持、精益管控和價值挖掘，持續提升企業全過程咨詢服務效率和服務價值。